Épisode 1
Les nouvelles troublantes dévoilées par Mark Collins à l'équipe Scorpion poussent Walter et ses acolytes à collaborer malgré eux avec leur pire ennemi.
Épisode 2
L'équipe est contrainte de s'affranchir des règles dans l'espoir d'empêcher la survenue d'une catastrophe mondiale. Cabe fait face aux conséquences de ses choix.
Épisode 3
Confrontés à des problèmes financiers, les membres de l'équipe Scorpion se rendent en Afrique pour empêcher une bande de braconniers de sévir.
Épisode 4
L'équipe intervient sur un ancien site militaire renfermant un missile nucléaire, tandis que les erreurs d'Happy finissent par insupporter Paige.
Épisode 5
Walter et Paige se rendent à une convention sur les nouvelles technologies où se pressent des invités inattendus. Sly tente de décrocher son examen.
Épisode 6
L'équipe inspecte le Queen Mary après avoir été engagée par un documentariste souhaitant prouver ou réfuter une fois pour toutes l'existence des fantômes.
Épisode 7
Une nouvelle voisine fait son apparition, l'équipe inspecte les égouts à la recherche d'un puissant gadget, et Cabe et Toby discutent du procès à venir.
Épisode 8
La carrière de Sly connaît des débuts houleux. L'équipe se rend à un festival de la Renaissance. Walter tente de recoller les morceaux avec Paige.
Épisode 9
Walter, Happy et Flo prennent le large pour tenter de détruire une île flottante constituée de déchets plastiques.
Épisode 10
Alors que la tension monte entre Walter et Cabe, l'équipe n'a pas une minute à perdre pour venir en aide aux victimes d'un crash d'avion.
Épisode 11
Stressée par le procès de Cabe, l'équipe tente de se concentrer sur des choses positives en volant au secours d'un chien diabétique coincé sous terre.
Épisode 12
Après s'être cogné la tête en tombant pendant la nuit de Noël, Walter imagine une vie dans laquelle l'équipe Scorpion n'aurait jamais existé.
Épisode 13
En testant un bunker apocalyptique doté d'une intelligence artificielle, l'équipe découvre un certain nombre de dysfonctionnements.
Épisode 14
Deux ados aux commandes d'un petit avion voient leur vie menacée quand une panne de courant massive coupe toute communication avec le sol.
Épisode 15
Un tsunami menace de détruire une vieille centrale nucléaire située au Mexique. À Los Angeles, Toby aide une ex-fiancée à retrouver son identité.
Épisode 16
Il y a de l'amour dans l'air pour la Saint-Valentin, du moins c'est ce qu'espère Ralph ! Un crash d'hélicoptère requiert l'intervention immédiate de l'équipe Scorpion.
Épisode 17
Alors qu'ils visitent un laboratoire souterrain caché dans les Rocheuses, les membres de l'équipe Scorpion voient leurs facultés intellectuelles étrangement diminuées.
Épisode 18
Pour arriver à la clinique à temps alors qu'un hold-up est en cours à la banque, l'équipe Scorpion va devoir faire preuve d'ingéniosité.
Épisode 19
Les membres de l'équipe se rendent à La Nouvelle-Orléans pour combattre une épidémie de moustiques. Sly et Ralph emploient les grands moyens pour venir en aide à Patty.
Épisode 20
Contrainte de participer à un tournoi de softball organisé par le gouvernement, l'équipe Scorpion ramène sa science pour tenter de briller sur le terrain.
Épisode 21
Les membres de l'équipe font une découverte troublante dans la roue de leur avion. Walter ne peut cacher sa culpabilité. Cabe tente d'encourager Sly.
Épisode 22
L'équipe Scorpion se rend en mission en Afrique. Happy et Toby prennent une grande décision. La relation de Paige et Walter prend un nouveau tournant.
